Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srrm1Q52KI8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srrm1Q52KI8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srrm1Q52KI8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms