Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC38Q502W7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC38Q502W7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC38Q502W7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms