Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KHDC1Q4VXA5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KHDC1Q4VXA5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KHDC1Q4VXA5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms