Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc3lQ4KL14 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc3lQ4KL14 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms