Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf38aQ4FK66 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf38aQ4FK66 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms