Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil2Q3V3V9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Carmil2Q3V3V9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Carmil2Q3V3V9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms