Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C87499Q3UX49 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C87499Q3UX49 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.4 ms