Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SfswapQ3USH5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SfswapQ3USH5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms