Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc33Q3ULW6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms