Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Tnrc6cQ3UHC0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms