Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Carmil3Q3UFQ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Carmil3Q3UFQ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Carmil3Q3UFQ8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms