Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam35aQ3UEN2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam35aQ3UEN2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam35aQ3UEN2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms