Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEI1

Pde4c, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4cQ3UEI1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pde4cQ3UEI1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pde4cQ3UEI1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Pde4cQ3UEI1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Pde4cQ3UEI1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms