Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srebf2Q3U1N2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srebf2Q3U1N2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srebf2Q3U1N2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms