Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDRF1Q3B7T1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDRF1Q3B7T1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms