Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPEL1Q2QD12 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPEL1Q2QD12 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms