Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FXNQ16595 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FXNQ16595 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FXNQ16595 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FXNQ16595 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FXNQ16595 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FXNQ16595 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FXNQ16595 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FXNQ16595 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FXNQ16595 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FXNQ16595 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FXNQ16595 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FXNQ16595 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FXNQ16595 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FXNQ16595 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FXNQ16595 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FXNQ16595 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FXNQ16595 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FXNQ16595 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FXNQ16595 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FXNQ16595 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FXNQ16595 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FXNQ16595 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FXNQ16595 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FXNQ16595 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FXNQ16595 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FXNQ16595 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FXNQ16595 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FXNQ16595 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FXNQ16595 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FXNQ16595 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FXNQ16595 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FXNQ16595 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FXNQ16595 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FXNQ16595 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FXNQ16595 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FXNQ16595 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FXNQ16595 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FXNQ16595 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FXNQ16595 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FXNQ16595 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FXNQ16595 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FXNQ16595 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FXNQ16595 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FXNQ16595 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FXNQ16595 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FXNQ16595 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FXNQ16595 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FXNQ16595 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FXNQ16595 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FXNQ16595 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FXNQ16595 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FXNQ16595 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FXNQ16595 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FXNQ16595 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FXNQ16595 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FXNQ16595 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FXNQ16595 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FXNQ16595 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FXNQ16595 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FXNQ16595 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FXNQ16595 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FXNQ16595 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FXNQ16595 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FXNQ16595 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FXNQ16595 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FXNQ16595 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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