Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC6Q16204 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC6Q16204 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC6Q16204 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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