Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1AQ15573 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF1AQ15573 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1228.4 ms