Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.56e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.576e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.596e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 511.29□□□□□ -0.66e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.656e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.656e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 511.01□□□□□ -0.656e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 410.53□□□□□ -0.726e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.826e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.856e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.896e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 CUX1-219ENST00000606749 601 ntTSL 48.49□□□□□ -1.056e-6■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.041e-16■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-16■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.881e-16■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 SNRPA-210ENST00000601393 969 ntTSL 318.62■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 34.5
PCBP1Q15365 RPL12-204ENST00000497825 864 ntTSL 219.57■□□□□ 0.721e-32■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 RPL12-203ENST00000497322 2275 ntTSL 216.62■□□□□ 0.251e-32■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 RPL12-205ENST00000536368 499 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.381e-32■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 RPL12-201ENST00000361436 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.991e-32■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 MRPL38-204ENST00000464758 752 ntTSL 324.54■■□□□ 1.529e-10■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 MRPL38-216ENST00000585475 580 ntTSL 523.49■■□□□ 1.359e-10■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 MRPL38-213ENST00000493104 1116 ntTSL 221.42■■□□□ 1.029e-10■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 MRPL38-203ENST00000461602 880 ntTSL 320.63■□□□□ 0.899e-10■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 MRPL38-214ENST00000493383 727 ntTSL 219.56■□□□□ 0.729e-10■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 MRPL38-209ENST00000477736 843 ntTSL 218.98■□□□□ 0.639e-10■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 MRPL38-206ENST00000474548 529 ntTSL 218.95■□□□□ 0.629e-10■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 MRPL38-215ENST00000494179 870 ntTSL 318.33■□□□□ 0.529e-10■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 AL139011.2-202ENST00000485079 914 ntTSL 310.53□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 PEX19-204ENST00000467711 205 ntTSL 39.07□□□□□ -0.962e-9■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 PEX19-205ENST00000472750 3504 ntTSL 1 (best)8.98□□□□□ -0.972e-9■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.162e-9■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 KIF2A-204ENST00000504883 783 ntTSL 210.06□□□□□ -0.83e-15■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 KIF2A-210ENST00000514082 874 ntTSL 1 (best)7.19□□□□□ -1.263e-15■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.443e-15■■■■■ 34.4
PCBP1Q15365 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.469e-8■■■■■ 34.3
PCBP1Q15365 AC087289.3-201ENST00000590947 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.09■□□□□ 0.499e-8■■■■■ 34.3
PCBP1Q15365 AC087289.3-202ENST00000593156 4270 ntTSL 211.82□□□□□ -0.529e-8■■■■■ 34.3
PCBP1Q15365 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.351e-10■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.812e-6■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.243e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 322.67■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 320.56■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.413e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.283e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 LRP10-205ENST00000553002 1065 ntTSL 216.19■□□□□ 0.183e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 415.94■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 RBM10-205ENST00000496012 509 ntTSL 515.41■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 DNM2-219ENST00000591818 538 ntTSL 415.38■□□□□ 0.053e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 DNM2-215ENST00000590806 5651 ntTSL 214.54□□□□□ -0.083e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 DNM2-221ENST00000593203 2507 ntTSL 214.19□□□□□ -0.143e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 GPATCH8-211ENST00000635257 5602 ntTSL 511.49□□□□□ -0.573e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.683e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 GPATCH8-205ENST00000587228 4713 ntTSL 1 (best)9.97□□□□□ -0.813e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 GPATCH8-201ENST00000335500 8109 ntTSL 29.14□□□□□ -0.953e-12■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 522.45■■□□□ 1.185e-27■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 221.97■■□□□ 1.115e-27■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.645e-27■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 517.38■□□□□ 0.375e-27■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.225e-27■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 312.38□□□□□ -0.435e-27■■■■■ 34.2
PCBP1Q15365 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 34.1
PCBP1Q15365 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 34.1
PCBP1Q15365 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 34.1
PCBP1Q15365 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 34.1
PCBP1Q15365 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.259e-10■■■■■ 34.1
PCBP1Q15365 MRPL38-217ENST00000588620 498 ntTSL 314.28□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 34.1
PCBP1Q15365 MRPL38-208ENST00000477371 566 ntTSL 211.21□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 34.1
PCBP1Q15365 MRPL38-207ENST00000477023 446 ntTSL 310.76□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 34.1
PCBP1Q15365 MRPL38-211ENST00000483393 525 ntTSL 210.76□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 34.1
PCBP1Q15365 MRPL38-210ENST00000480203 534 ntTSL 39.78□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 34.1
PCBP1Q15365 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 514.29□□□□□ -0.126e-7■■■■■ 34
PCBP1Q15365 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.071e-16■■■■■ 33.8
PCBP1Q15365 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.151e-16■■■■■ 33.8
PCBP1Q15365 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.258e-7■■■■■ 33.8
PCBP1Q15365 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 33.8
PCBP1Q15365 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.027e-7■■■■■ 33.8
PCBP1Q15365 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.297e-7■■■■■ 33.8
PCBP1Q15365 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 33.8
PCBP1Q15365 POLR2A-209ENST00000617998 6751 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 33.8
PCBP1Q15365 CTSD-214ENST00000637937 1262 ntTSL 518.84■□□□□ 0.611e-12■■■■■ 33.8
PCBP1Q15365 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 33.8
PCBP1Q15365 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 33.8
PCBP1Q15365 SPNS1-209ENST00000567771 829 ntTSL 328.3■■■□□ 2.124e-9■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 SPNS1-212ENST00000568900 2253 ntTSL 222.35■■□□□ 1.174e-9■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 SPNS1-210ENST00000568388 759 ntTSL 320.57■□□□□ 0.884e-9■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 ZNF385A-215ENST00000552382 1516 ntTSL 322.99■■□□□ 1.274e-6■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 NFAT5-204ENST00000426654 14219 ntTSL 1 (best)7.93□□□□□ -1.143e-10■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.193e-10■■■■■ 33.7
PCBP1Q15365 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.343e-10■■■■■ 33.7
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