Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGCGQ13326 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGCGQ13326 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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