Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRJQ12913 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPRJQ12913 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRJQ12913 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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