Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4Q0VGL1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMTOR4Q0VGL1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 591.9 ms