Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CGNL1Q0VF96 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CGNL1Q0VF96 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CGNL1Q0VF96 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CGNL1Q0VF96 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms