Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDH1Q08174 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDH1Q08174 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDH1Q08174 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms