Protein–RNA interactions for Protein: Q07657

SHS1, Seventh homolog of septin 1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHS1Q07657 YKR073CYKR073C 321 nt5.41□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 PZF1YPR186C 1290 nt5.41□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 TRP3YKL211C 1455 nt5.4□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 ADE4YMR300C 1533 nt5.4□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.4□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 NQM1YGR043C 1002 nt5.4□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 MSS116YDR194C 1995 nt5.4□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 THP1YOL072W 1368 nt5.4□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 RFA1YAR007C 1866 nt5.39□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 ERD1YDR414C 1089 nt5.39□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 JAC1YGL018C 555 nt5.39□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.39□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 NIT2YJL126W 924 nt5.39□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 YJU2YKL095W 837 nt5.39□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 YML131WYML131W 1098 nt5.39□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 CKB2YOR039W 777 nt5.39□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 TOM5YPR133W-A 153 nt5.39□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 YIL067CYIL067C 2037 nt5.38□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 APN1YKL114C 1104 nt5.38□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 ECM15YBL001C 315 nt5.38□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 MRPL4YLR439W 960 nt5.38□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 SLD7YOR060C 774 nt5.38□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 VPS72YDR485C 2388 nt5.38□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 TKL1YPR074C 2043 nt5.38□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 HPF1YOL155C 2904 nt5.37□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 SSZ1YHR064C 1617 nt5.37□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 SAC6YDR129C 1929 nt5.37□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 VCX1YDL128W 1236 nt5.37□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 MPM1YJL066C 759 nt5.37□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 KTI12YKL110C 942 nt5.37□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 YBR016WYBR016W 387 nt5.37□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 YNL247WYNL247W 2304 nt5.37□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 DRN1YGR093W 1524 nt5.37□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 GDB1YPR184W 4611 nt5.37□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 TNA1YGR260W 1605 nt5.37□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 HAP1YLR256W 4509 nt5.36□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 SFB3YHR098C 2790 nt5.36□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 FAU1YER183C 636 nt5.36□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.36□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 PUS6YGR169C 1215 nt5.36□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 RBA50YDR527W 1320 nt5.36□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 PRR1YKL116C 1557 nt5.35□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 NOP8YOL144W 1455 nt5.35□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 YEL077CYEL077C 3834 nt5.35□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 YKR041WYKR041W 753 nt5.35□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 RPL3YOR063W 1164 nt5.35□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 CAM1YPL048W 1248 nt5.35□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 SEC18YBR080C 2277 nt5.35□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 LDB19YOR322C 2457 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 AIM17YHL021C 1398 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 COT1YOR316C 1320 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 IWR1YDL115C 1062 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 SRG1SRG1 551 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 ARO2YGL148W 1131 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 CAB4YGR277C 918 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 YJL171CYJL171C 1191 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 MTW1YAL034W-A 870 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 PEX22YAL055W 543 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 FEX1YOR390W 1128 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 FEX2YPL279C 1128 nt5.34□□□□□ -1.55
SHS1Q07657 GSY2YLR258W 2118 nt5.33□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 AAP1YHR047C 2571 nt5.33□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 VHS1YDR247W 1386 nt5.33□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 YDR053WYDR053W 396 nt5.33□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.33□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 NSG1YHR133C 876 nt5.33□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 YJL107CYJL107C 1164 nt5.33□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 ATG33YLR356W 594 nt5.33□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 CWC27YPL064C 906 nt5.33□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 BPL1YDL141W 2073 nt5.33□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 ARP1YHR129C 1155 nt5.32□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 SER33YIL074C 1410 nt5.31□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 VPS29YHR012W 849 nt5.31□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 SPL2YHR136C 447 nt5.31□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 GUP2YPL189W 1830 nt5.31□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 NOT3YIL038C 2511 nt5.31□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 HXT4YHR092C 1731 nt5.31□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 ECM7YLR443W 1347 nt5.3□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 DAK1YML070W 1755 nt5.3□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 FUN19YAL034C 1242 nt5.3□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 NSI1YDR026C 1713 nt5.3□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 YOR1YGR281W 4434 nt5.3□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 NGR1YBR212W 2019 nt5.3□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 VID30YGL227W 2877 nt5.3□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 PDI1YCL043C 1569 nt5.29□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 GLT1YDL171C 6438 nt5.29□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 RIM101YHL027W 1878 nt5.29□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 XPT1YJR133W 630 nt5.29□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 SCW10YMR305C 1170 nt5.29□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 LSG1YGL099W 1923 nt5.29□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 BZZ1YHR114W 1902 nt5.29□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 MLF3YNL074C 1359 nt5.29□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 PAP1YKR002W 1707 nt5.28□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 CTS1YLR286C 1689 nt5.28□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.28□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 YNG2YHR090C 849 nt5.28□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.28□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 ISU2YOR226C 471 nt5.28□□□□□ -1.56
SHS1Q07657 PDR10YOR328W 4695 nt5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 112.8 ms