Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MestQ07646 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MestQ07646 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MestQ07646 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MestQ07646 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MestQ07646 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MestQ07646 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MestQ07646 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MestQ07646 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MestQ07646 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MestQ07646 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MestQ07646 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MestQ07646 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MestQ07646 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MestQ07646 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MestQ07646 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MestQ07646 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MestQ07646 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MestQ07646 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MestQ07646 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MestQ07646 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MestQ07646 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MestQ07646 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MestQ07646 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MestQ07646 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MestQ07646 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MestQ07646 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MestQ07646 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MestQ07646 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MestQ07646 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MestQ07646 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MestQ07646 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MestQ07646 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MestQ07646 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MestQ07646 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MestQ07646 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MestQ07646 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MestQ07646 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MestQ07646 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MestQ07646 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MestQ07646 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MestQ07646 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MestQ07646 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MestQ07646 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MestQ07646 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MestQ07646 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MestQ07646 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MestQ07646 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MestQ07646 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MestQ07646 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MestQ07646 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MestQ07646 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MestQ07646 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MestQ07646 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MestQ07646 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MestQ07646 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MestQ07646 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MestQ07646 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MestQ07646 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MestQ07646 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MestQ07646 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MestQ07646 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MestQ07646 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MestQ07646 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MestQ07646 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MestQ07646 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MestQ07646 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MestQ07646 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MestQ07646 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MestQ07646 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MestQ07646 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MestQ07646 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MestQ07646 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MestQ07646 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MestQ07646 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MestQ07646 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MestQ07646 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MestQ07646 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms