Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Col17a1Q07563 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Col17a1Q07563 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Col17a1Q07563 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Col17a1Q07563 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms