Protein–RNA interactions for Protein: Q06330

RBPJ, Recombining binding protein suppressor of hairless, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPJQ06330 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RBPJQ06330 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBPJQ06330 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms