Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDSPL2Q05D32 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CTDSPL2Q05D32 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTDSPL2Q05D32 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms