Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CALD1Q05682 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CALD1Q05682 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CALD1Q05682 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms