Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCEQ02156 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCEQ02156 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCEQ02156 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.1 ms