Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE1BQ01064 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE1BQ01064 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE1BQ01064 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms