Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM3AP98173 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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FAM3AP98173 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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FAM3AP98173 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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FAM3AP98173 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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FAM3AP98173 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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FAM3AP98173 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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FAM3AP98173 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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FAM3AP98173 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM3AP98173 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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FAM3AP98173 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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FAM3AP98173 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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FAM3AP98173 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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FAM3AP98173 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM3AP98173 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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