Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNB1P98172 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNB1P98172 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms