Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbbp6P97868 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp6P97868 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp6P97868 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms