Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ElocP83940 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ElocP83940 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ElocP83940 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ElocP83940 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ElocP83940 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ElocP83940 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ElocP83940 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ElocP83940 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ElocP83940 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ElocP83940 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ElocP83940 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ElocP83940 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ElocP83940 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ElocP83940 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ElocP83940 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ElocP83940 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ElocP83940 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ElocP83940 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ElocP83940 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ElocP83940 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ElocP83940 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ElocP83940 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ElocP83940 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ElocP83940 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ElocP83940 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ElocP83940 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ElocP83940 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ElocP83940 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ElocP83940 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ElocP83940 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ElocP83940 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ElocP83940 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ElocP83940 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ElocP83940 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ElocP83940 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ElocP83940 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ElocP83940 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ElocP83940 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ElocP83940 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ElocP83940 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ElocP83940 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ElocP83940 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ElocP83940 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ElocP83940 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ElocP83940 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ElocP83940 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ElocP83940 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ElocP83940 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ElocP83940 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ElocP83940 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ElocP83940 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ElocP83940 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ElocP83940 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ElocP83940 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ElocP83940 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ElocP83940 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ElocP83940 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ElocP83940 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ElocP83940 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ElocP83940 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ElocP83940 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ElocP83940 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ElocP83940 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ElocP83940 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ElocP83940 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElocP83940 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElocP83940 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElocP83940 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElocP83940 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElocP83940 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElocP83940 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElocP83940 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElocP83940 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElocP83940 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ElocP83940 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElocP83940 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElocP83940 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElocP83940 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElocP83940 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElocP83940 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElocP83940 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElocP83940 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElocP83940 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElocP83940 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElocP83940 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ElocP83940 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ElocP83940 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ElocP83940 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ElocP83940 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ElocP83940 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ElocP83940 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ElocP83940 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ElocP83940 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ElocP83940 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ElocP83940 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ElocP83940 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ElocP83940 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ElocP83940 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ElocP83940 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms