Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cbx1P83917 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cbx1P83917 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx1P83917 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms