Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX5P78411 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX5P78411 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX5P78411 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX5P78411 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX5P78411 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRX5P78411 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX5P78411 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX5P78411 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX5P78411 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX5P78411 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX5P78411 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRX5P78411 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX5P78411 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRX5P78411 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX5P78411 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX5P78411 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX5P78411 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX5P78411 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX5P78411 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX5P78411 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX5P78411 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX5P78411 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX5P78411 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX5P78411 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX5P78411 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX5P78411 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX5P78411 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX5P78411 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX5P78411 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX5P78411 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRX5P78411 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX5P78411 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX5P78411 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX5P78411 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX5P78411 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX5P78411 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX5P78411 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX5P78411 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX5P78411 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX5P78411 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX5P78411 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRX5P78411 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX5P78411 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX5P78411 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX5P78411 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX5P78411 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX5P78411 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX5P78411 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX5P78411 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX5P78411 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX5P78411 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX5P78411 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX5P78411 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX5P78411 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX5P78411 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX5P78411 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX5P78411 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX5P78411 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX5P78411 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX5P78411 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX5P78411 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX5P78411 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX5P78411 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX5P78411 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX5P78411 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX5P78411 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX5P78411 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX5P78411 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX5P78411 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX5P78411 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX5P78411 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX5P78411 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX5P78411 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX5P78411 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX5P78411 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX5P78411 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX5P78411 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRX5P78411 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX5P78411 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX5P78411 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX5P78411 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX5P78411 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX5P78411 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX5P78411 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX5P78411 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX5P78411 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX5P78411 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRX5P78411 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms