Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHC1P78364 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHC1P78364 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHC1P78364 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHC1P78364 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHC1P78364 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHC1P78364 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHC1P78364 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHC1P78364 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHC1P78364 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHC1P78364 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHC1P78364 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHC1P78364 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHC1P78364 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHC1P78364 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHC1P78364 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHC1P78364 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHC1P78364 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHC1P78364 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHC1P78364 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHC1P78364 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHC1P78364 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHC1P78364 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHC1P78364 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHC1P78364 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHC1P78364 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHC1P78364 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHC1P78364 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHC1P78364 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHC1P78364 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHC1P78364 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC1P78364 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC1P78364 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC1P78364 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC1P78364 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC1P78364 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC1P78364 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC1P78364 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC1P78364 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC1P78364 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC1P78364 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC1P78364 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHC1P78364 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHC1P78364 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHC1P78364 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHC1P78364 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHC1P78364 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHC1P78364 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHC1P78364 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHC1P78364 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHC1P78364 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHC1P78364 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHC1P78364 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHC1P78364 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHC1P78364 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHC1P78364 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHC1P78364 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHC1P78364 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHC1P78364 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHC1P78364 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms