Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frat1P70339 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frat1P70339 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Frat1P70339 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frat1P70339 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frat1P70339 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frat1P70339 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Frat1P70339 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frat1P70339 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Frat1P70339 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Frat1P70339 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms