Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2bP62915 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2bP62915 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2bP62915 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2bP62915 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms