Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SnrpfP62307 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms