Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFM1P61960 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFM1P61960 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UFM1P61960 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFM1P61960 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFM1P61960 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFM1P61960 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFM1P61960 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFM1P61960 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFM1P61960 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFM1P61960 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFM1P61960 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFM1P61960 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFM1P61960 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFM1P61960 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFM1P61960 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFM1P61960 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFM1P61960 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFM1P61960 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFM1P61960 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFM1P61960 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFM1P61960 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFM1P61960 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFM1P61960 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFM1P61960 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFM1P61960 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFM1P61960 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFM1P61960 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFM1P61960 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFM1P61960 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFM1P61960 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFM1P61960 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UFM1P61960 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFM1P61960 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFM1P61960 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFM1P61960 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFM1P61960 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFM1P61960 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFM1P61960 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFM1P61960 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFM1P61960 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFM1P61960 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFM1P61960 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFM1P61960 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFM1P61960 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFM1P61960 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFM1P61960 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFM1P61960 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFM1P61960 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFM1P61960 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFM1P61960 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFM1P61960 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFM1P61960 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFM1P61960 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFM1P61960 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFM1P61960 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFM1P61960 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UFM1P61960 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFM1P61960 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFM1P61960 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFM1P61960 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFM1P61960 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFM1P61960 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFM1P61960 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFM1P61960 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFM1P61960 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFM1P61960 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFM1P61960 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFM1P61960 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFM1P61960 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFM1P61960 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFM1P61960 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UFM1P61960 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UFM1P61960 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UFM1P61960 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms