Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snap25P60879 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snap25P60879 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snap25P60879 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snap25P60879 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snap25P60879 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snap25P60879 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snap25P60879 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snap25P60879 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snap25P60879 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snap25P60879 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snap25P60879 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snap25P60879 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snap25P60879 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snap25P60879 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms