Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM3BP58499 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3BP58499 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms