Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Exosc10P56960 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Exosc10P56960 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc10P56960 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms