Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp5P56399 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp5P56399 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp5P56399 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp5P56399 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp5P56399 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp5P56399 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp5P56399 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp5P56399 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp5P56399 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp5P56399 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp5P56399 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp5P56399 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms