Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP7P55210 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP7P55210 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP7P55210 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP7P55210 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP7P55210 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP7P55210 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASP7P55210 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP7P55210 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP7P55210 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP7P55210 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP7P55210 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP7P55210 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP7P55210 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP7P55210 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASP7P55210 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP7P55210 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP7P55210 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP7P55210 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP7P55210 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP7P55210 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP7P55210 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASP7P55210 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASP7P55210 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP7P55210 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP7P55210 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP7P55210 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP7P55210 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP7P55210 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP7P55210 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP7P55210 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASP7P55210 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP7P55210 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP7P55210 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP7P55210 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP7P55210 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP7P55210 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP7P55210 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP7P55210 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP7P55210 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP7P55210 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP7P55210 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP7P55210 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASP7P55210 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASP7P55210 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASP7P55210 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASP7P55210 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CASP7P55210 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP7P55210 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP7P55210 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP7P55210 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CASP7P55210 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP7P55210 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP7P55210 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP7P55210 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP7P55210 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP7P55210 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP7P55210 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP7P55210 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP7P55210 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP7P55210 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CASP7P55210 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CASP7P55210 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CASP7P55210 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CASP7P55210 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASP7P55210 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CASP7P55210 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CASP7P55210 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASP7P55210 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASP7P55210 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP7P55210 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP7P55210 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP7P55210 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CASP7P55210 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP7P55210 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP7P55210 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP7P55210 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP7P55210 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP7P55210 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP7P55210 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP7P55210 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP7P55210 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASP7P55210 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP7P55210 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP7P55210 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP7P55210 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP7P55210 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms