Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EMP3P54852 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EMP3P54852 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMP3P54852 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMP3P54852 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMP3P54852 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMP3P54852 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMP3P54852 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMP3P54852 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMP3P54852 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMP3P54852 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMP3P54852 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EMP3P54852 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMP3P54852 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMP3P54852 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMP3P54852 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMP3P54852 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMP3P54852 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMP3P54852 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMP3P54852 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EMP3P54852 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EMP3P54852 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMP3P54852 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMP3P54852 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMP3P54852 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMP3P54852 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMP3P54852 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMP3P54852 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMP3P54852 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMP3P54852 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMP3P54852 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMP3P54852 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMP3P54852 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMP3P54852 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMP3P54852 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMP3P54852 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP3P54852 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP3P54852 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP3P54852 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP3P54852 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP3P54852 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP3P54852 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP3P54852 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP3P54852 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMP3P54852 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMP3P54852 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMP3P54852 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMP3P54852 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP3P54852 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP3P54852 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP3P54852 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP3P54852 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP3P54852 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP3P54852 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP3P54852 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP3P54852 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP3P54852 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMP3P54852 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP3P54852 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP3P54852 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP3P54852 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP3P54852 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP3P54852 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP3P54852 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP3P54852 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP3P54852 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMP3P54852 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP3P54852 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP3P54852 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP3P54852 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP3P54852 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP3P54852 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMP3P54852 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP3P54852 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP3P54852 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP3P54852 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP3P54852 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP3P54852 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP3P54852 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMP3P54852 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP3P54852 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP3P54852 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP3P54852 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP3P54852 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP3P54852 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP3P54852 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EMP3P54852 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms